داستان و ماجراهای بازی، تا حد زیادی مستقل و منحصربه‌فرد هستند و تنها در همین نسخه از بازی مرد عنکبوتی یعنی Spider-Man: Friend or Foe دیده شده‌اند. سازندگان بازی در توضیحات آن اظهار داشته‌اند که این نسخه براساس سه‌گانهٔ سینمایی «مرد عنکبوتی» ساخته شده است.