کنترل باکتری عامل بیماری پوسیدگی نرم بهدلیل بذرزاد و خاکزاد بودن و پایداری آن در خاک و بقایای آلوده گیاهی و نیز داشتن میزبانهای متعدد، مشکل میباشد. بنابراین بیماری را بایستی به صورت تلفیقی و با بهکارگیری اصول علمی و دقیق بهشرح زیر کنترل کرد:
1- غده های آلوده کشت نشوند. کاشت غده های سیب زمینی سالم در زمینهای عاری از بیماری انجام شود. در زمینهایی که سابقه آلودگی دارند، حداقل تناوب دو ساله با گیاهان غیر میزبان مانند غلات و حبوبات رعایت شود.
2- آبیاری مزرعه بهصورت بارانی یا قطره ای و با مهارت و دقت انجام شود بهنحوی که کمترین رواناب ایجاد گردد. از زیاد آب دادن و غرقاب کردن مزرعه اجتناب شود.
3- رعایت اصول بهداشت زراعی، تغذیه مناسب مزارع سیبزمینی و کنترل علفهای هرز مزرعه بهویژه علفهای هرز تاجریزی و تاج خروس ضروری میباشد.
4- زمانی که پوست غده ها سفت و کامل شده، برداشت انجام شود.
5-از برداشت محصول در شرایط مرطوب خودداری شود.
6- وقتی دمای هوا و خاک زیر 21 درجه سانتیگراد باشد، برداشت انجام شود.
7- از کوبیدن و لهکردن غده ها جلوگیری شود.
8- غده های برداشتشده بهسرعت خشک شوند.
9- قبل از جمعآوری و انبار کردن غده ها، خاک و ذرات چسبیده به غدهها تمیز شوند.
10- از انبار کردن غده های آبگزیده و دارای پوسیدگی صورتی خودداری شود.
11- انبارها و لوازم ذخیرهسازی غدهها ضدعفونی شوند. برای ضدعفونی انبار میتوان از آجرهای آماده فرمالدئید موجود در بازار و یا از وایتکس استفاده کرد.
12- از جمع شدن قطرات آب بر روی توده ذخیرهشده، جلوگیری شود.
13- فضای انبار بهطور مناسب تهویه شود.
14- غدهها بهمدت 2-3 هفته در دمای 13 -10 درجه سانتیگراد با جریان هوای مناسب تهویه شوند تا پوست غده های زخمی التیام یابد.
15- از شستن غدهها قبل از ذخیره کردن پرهیز شود.
16- در صورت نیاز به شستشوی غده ها، از آب کلردار استفاده شود و غده ها بیش از 5/2 تا 5 سانتیمتر در آب غوطه ور نشوند.
17- غدهها قبل از بستهبندی کاملاً خشک شوند.
18- غدهها در کیسه های توری بستهبندی شوند.
19- در مزارع و خاک هایی که از قبل احتمال آلوده بودن را دارند، بهتر است ارقام مقاوم و یا متحمل به بیماری کشت شوند. در بررسی آزمایشگاهی انجامشده، ارقام: کندور، دیامانت، آرانکا، مورن، سانته و کوزیما تحمل بیشتری به عامل بیماری نشان دادند ولی در بررسیهای گلخانهای، ارقام: ریمارکا و مارفونا متحمل و ارقام: آئولا، استت، آجیبا، ایلونا، فاموزا و آزیزا نسبتاً حساس و ارقام: سینجا، سرناد، ایدول، کندور، رومانو، آرانکا و دیامانت حساس بودند. در بررسیهای سهساله واکنش ارقام به P.c.c، رقم مورن نسبت به بقیه ارقام آزمونشده تحمل بیشتر و رقم کندور حساسیت بیشتر نشان دادند.
20- هنگام برداشت بایستی دقت شود که غده های سیب زمینی زخمی نشوند. اگر برداشت در خاک خشک انجام شود، غده ها زخمی شده و در انبار آلوده می شوند. هنگام برداشت بایستی غده ها خشک باشند. وجود آب آزاد روی غده ها خصوصاً در ناحیه چشم ها باعث نفوذ باکتری عامل بیماری به داخل غده شده و بیماری ایجاد می شود.